Kelemahan Itachi adalah di fisik. Yahh.. Karakter yg sang at jenius, baik dan kuat ini memiliki kelemahan yg cukup merepotkan.
.
Dia tidak memiliki chakra sebanyak ninja pada umumnya, karena itu dia cenderung menggunakan "Counter Attack" untuk menghadapi musuhnya.
.
Dia juga cukup cerdik dalam mengatur penggunaan Chakranya. Seperti saat melawan Sasuke, dia hampir mampu mengimbangi adiknya walau Chakranya telah terkuras banyak.
.
Ada juga yg mengatakan kalau Itachi juga sebenarnya mengidap sebuah penyakit. Namun itu masih belum dijelaskan baik di Komik, Anime, Databook, maupun Novel.